El actual edificio abierto al público se ubica en la Plaza de las Platerías, en el espacio del antiguo Banco de España, inmueble proyectado por el arquitecto Romualdo de Madariaga e inaugurado en 1949. Aquel edificio fue remodelado por Manuel Gallego Jorreto, entre 2009 y 2012, para adaptarlo a las necesidades museísticas, y el Museo de las Peregrinaciones y de Santiago se instaló allí en noviembre de 2015 trasladando sus obras maestras desde la Casa Gótica -antigua sede expositiva y en la actualidad sede administrativa-.

La actual exposición permanente, distribuida en tres plantas, se centra en las siguientes áreas: la peregrinación como fenómeno universal, el Camino de Santiago y la peregrinación Xacobea y, por último, la ciudad de Santiago. En relación con este discurso se exponen esculturas, pintura, grabados, libros, documentos, etc., que explican las peregrinaciones en sentido amplio.

Así mismo, el museo realiza varias exposiciones temporales a lo largo del año.